Microbiology Models

These models and simulations have been tagged “Microbiology”.

A model of the exponential growth and collapse of E. coli .
Science Exponential Growth Collapse Bacteria Biology Microbiology
A model of the exponential growth and collapse of E. coli.
E coli life cycle model
Edythe
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A model of the exponential growth phase of E. coli growth.
Microbiology Exponential Growth Bacteria Biology
A model of the exponential growth phase of E. coli growth.
E coli growth model
Edythe
6
Il modello dinamico di Baranyi e Roberts per la curva di crescita di microrganismi (Baranyi, J., Roberts, T. (1994). A dynamic approach to predicting bacterial growth in food International journal of food microbiology  23(), 1 - 18). __ E' un modello dinamico che assume che la fase lag sia dovut
Microbiology Bacterial Growth Predictive Microbiology Richards Curves Biology
Il modello dinamico di Baranyi e Roberts per la curva di crescita di microrganismi (Baranyi, J., Roberts, T. (1994). A dynamic approach to predicting bacterial growth in food International journal of food microbiology  23(), 1 - 18).

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E' un modello dinamico che assume che la fase lag sia dovuto all'accumulo di un composto essenziale (la cui quantità iniziale riflette lo stato iniziale delle cellule nell'ambiente E1, da cui provengono), secondo una cinetica di primo ordine, ad una velocità che dipende dall'ambiente E2. Il modello è lievemente modificato rispetto all'originale, per evitare che la quantità del prodotto essenziale tenda all'infinito. 
D-model (curve di Richards)
Eugenio Parente
14 6 months ago
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Predictive Microbiology Richards Curves Bacterial Growth Microbiology Biology
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Crescita esponenziale, modello logistico con esponente (curve di Richards)
Eugenio Parente
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A model of the exponential growth and collapse of E. coli .
Bacteria Exponential Growth Collapse Biology Microbiology Science
A model of the exponential growth and collapse of E. coli.
Clone of E coli life cycle model
Pallavi Joshi
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica
Biology Microbiology
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica
Crescita esponenziale
Eugenio Parente
27
Un modello per l'effetto di alcuni fattori (T, pH, aW, conservanti) e della competizione/amensalismo sulla crescita di una comunità microbica semplificata (Listeria monocytogenes, Latilactobacillus sakei) negli alimenti. Lo scopo del modello è illustrare concetti come: a. la crescita in assenza o
Biology Microbiology Bacterial Growth Richards Curves Predictive Microbiology
Un modello per l'effetto di alcuni fattori (T, pH, aW, conservanti) e della competizione/amensalismo sulla crescita di una comunità microbica semplificata (Listeria monocytogenes, Latilactobacillus sakei) negli alimenti.
Lo scopo del modello è illustrare concetti come:
a. la crescita in assenza o in presenza di competizione/amensalismo
b. l'effetto delle interazioni microbiche
c. l'effetto di alcuni fattori ambientali e tecnologici
Il sistema potrebbe ragionevolmente rappresentare un insaccato fermentato durante la produzione. Tuttavia non ho inserito quelli che potrebbero essere effetti di declino delle popolazioni dovuti alle condizioni avverse durante la stagionatura e conservazione.
Dinamica di una comunità microbica negli alimenti
Eugenio Parente
6 months ago
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Biology Microbiology
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Crescita esponenziale, modello logistico
Eugenio Parente
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A model of the exponential growth and collapse of E. coli .
Biology Science Microbiology Bacteria Collapse Exponential Growth
A model of the exponential growth and collapse of E. coli.
Clone of E coli life cycle model
Ismael Costa
A model of the exponential growth and collapse of E. coli .
Bacteria Science Microbiology Collapse Biology Exponential Growth
A model of the exponential growth and collapse of E. coli.
Clone of E coli life cycle model
Frankie LAU
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica
Microbiology Biology
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica
Crescita esponenziale (con storytelling)
Eugenio Parente
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A model of the exponential growth and collapse of E. coli .
Exponential Growth Science Microbiology Biology Bacteria Collapse
A model of the exponential growth and collapse of E. coli.
Clone of E coli life cycle model
Ismael Costa
A model of the exponential growth and collapse of E. coli .
Bacteria Biology Exponential Growth Microbiology Science Collapse
A model of the exponential growth and collapse of E. coli.
Clone of E coli life cycle model
William Edward Hahn
Un modello per l'effetto della temperatura (costante) sulla crescita di un pericoloso patogeno, agente di tossinfezioni alimentari (Listeria monocytogenes) __ Il modello è basato su questo Insight https://insightmaker.com/insight/206861/D-model-curve-di-Richards-con-ln-alpha-lag-mu
Microbiology Bacterial Growth Predictive Microbiology Richards Curves Biology
Un modello per l'effetto della temperatura (costante) sulla crescita di un pericoloso patogeno, agente di tossinfezioni alimentari (Listeria monocytogenes)

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Il modello è basato su questo Insight https://insightmaker.com/insight/206861/D-model-curve-di-Richards-con-ln-alpha-lag-mu
Effetto della temperatura sulla crescita di L. monocytogenes
Eugenio Parente
3 6 months ago
Un modello dinamico per la produzione di Sakacin K (Leroy and De Vuyst, 1999). La sakacin K e' una batteriocina attiva contro Listeria monocytogenes prodotta da Latilactobacillus sakei CTC494 (un fermento lattico usato come starter nella produzione di insaccati fermentati). Il modello descrive
Predictive Microbiology Industrial Microbiology Microbiology
Un modello dinamico per la produzione di Sakacin K (Leroy and De Vuyst, 1999).

La sakacin K e' una batteriocina attiva contro Listeria monocytogenes prodotta da Latilactobacillus sakei CTC494 (un fermento lattico usato come starter nella produzione di insaccati fermentati). Il modello descrive la crescita, il consumo di substrato (glucosio), la produzione di acido lattico e batteriocina in funzione di pH di temperatura.
Sakacin K
Eugenio Parente
Il modello dinamico di Baranyi e Roberts per la curva di crescita di microrganismi (Baranyi, J., Roberts, T. (1994). A dynamic approach to predicting bacterial growth in food International journal of food microbiology  23(), 1 - 18). __ E' simile al D model (https://insightmaker.com/insight/2060
Richards Curves Predictive Microbiology Bacterial Growth Microbiology Biology
Il modello dinamico di Baranyi e Roberts per la curva di crescita di microrganismi (Baranyi, J., Roberts, T. (1994). A dynamic approach to predicting bacterial growth in food International journal of food microbiology  23(), 1 - 18).

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E' simile al D model (https://insightmaker.com/insight/206054/D-model-curve-di-Richards) ma qui la fase lag è esplicitamente inversamente proporzionale a mu. Questo semplifica alcuni calcoli quando mumax non è costante ma dipendente dalla temperatura. 
D-model (curve di Richards) con -ln(alpha)=lag*mu
Eugenio Parente
4
Questo modello usa un'altra ipotesi per la natura (e durata della fase lag). La popolazione N è composta da una frazione di cellule che non crescono NG e una di cellule che crescono immediatamente alla massima velocità, G. Il rapporto fra le due frazioni determina la durata della fase lag
Biology Microbiology
Questo modello usa un'altra ipotesi per la natura (e durata della fase lag). La popolazione N è composta da una frazione di cellule che non crescono NG e una di cellule che crescono immediatamente alla massima velocità, G. Il rapporto fra le due frazioni determina la durata della fase lag
Heterogeneous Population Model
Eugenio Parente
6 months ago
Un modello per l'effetto della temperatura (costante) sulla crescita di un pericoloso patogeno, agente di tossinfezioni alimentari (Listeria monocytogenes) __ Il modello è basato su questo Insight https://insightmaker.com/insight/206861/D-model-curve-di-Richards-con-ln-alpha-lag-mu
Richards Curves Biology Bacterial Growth Predictive Microbiology Microbiology
Un modello per l'effetto della temperatura (costante) sulla crescita di un pericoloso patogeno, agente di tossinfezioni alimentari (Listeria monocytogenes)

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Il modello è basato su questo Insight https://insightmaker.com/insight/206861/D-model-curve-di-Richards-con-ln-alpha-lag-mu
Clone of Effetto della temperatura sulla crescita di L. monocytogenes
Anita Aliano
6 months ago
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Richards Curves Biology Microbiology Bacterial Growth Predictive Microbiology
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Clone of Crescita esponenziale, modello logistico con esponente (curve di Richards)
roberta messina
6 months ago
Questo modello usa un'altra ipotesi per la natura (e durata della fase lag). La popolazione N è composta da una frazione di cellule che non crescono NG e una di cellule che crescono immediatamente alla massima velocità, G. Il rapporto fra le due frazioni determina la durata della fase lag
Microbiology Biology
Questo modello usa un'altra ipotesi per la natura (e durata della fase lag). La popolazione N è composta da una frazione di cellule che non crescono NG e una di cellule che crescono immediatamente alla massima velocità, G. Il rapporto fra le due frazioni determina la durata della fase lag
Clone of Heterogeneous Population Model
Anita Aliano
6 months ago
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Microbiology Biology Predictive Microbiology Richards Curves Bacterial Growth
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Clone of Crescita esponenziale, modello logistico con esponente (curve di Richards)
Anita Aliano
6 months ago
Il modello dinamico di Baranyi e Roberts per la curva di crescita di microrganismi (Baranyi, J., Roberts, T. (1994). A dynamic approach to predicting bacterial growth in food International journal of food microbiology  23(), 1 - 18). __ E' un modello dinamico che assume che la fase lag sia dovut
Bacterial Growth Biology Microbiology Predictive Microbiology Richards Curves
Il modello dinamico di Baranyi e Roberts per la curva di crescita di microrganismi (Baranyi, J., Roberts, T. (1994). A dynamic approach to predicting bacterial growth in food International journal of food microbiology  23(), 1 - 18).

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E' un modello dinamico che assume che la fase lag sia dovuto all'accumulo di un composto essenziale (la cui quantità iniziale riflette lo stato iniziale delle cellule nell'ambiente E1, da cui provengono), secondo una cinetica di primo ordine, ad una velocità che dipende dall'ambiente E2. Il modello è lievemente modificato rispetto all'originale, per evitare che la quantità del prodotto essenziale tenda all'infinito. 
Clone of D-model (curve di Richards)
sabina laveglia
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Biology Microbiology
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Clone of Crescita esponenziale, modello logistico
Anita Aliano
6 months ago
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Biology Microbiology
Un modello minimo per la crescita esponenziale di una popolazione microbica, con popolazione massima limitata
Clone of Crescita esponenziale, modello logistico
roberta messina
6 months ago